初見で笑ってしまったコメントですが、相剣はSテーマでしたね。
少なくとも深淵の獣が拘束具を武器としても利用しているとするならば、私の記憶から軒轅の2人を捕縛
（忘却）し、アルバス達に注意を誘導し、天底との媒介（チューニング）として取り込んでいる可能性は一周回ってあり得そうですね。

思えば、これ白（Sモンスター）なんですよね。
私はこの長編ストーリーを烙印ストーリーと呼んでいる一人として、これの登場に驚きました。しかし、我らが叡智的には各種カードから「白」もストーリーコンセプトの一要素ではないかと推測されている。
大方の予想（or期待）どおり、期末＝背景ストーリー完結（終幕）だとするならば、この神獣がラスボス？もしくは、第2幕のラスボスで第3幕（各幕数は適当）控えなのか？

烙印ストーリーはハッピーエンドをお願いしたいですな…

背景ストーリー的に①の関係者（系列・派生）だけど、純粋種（深淵の獣）ではない書き方に管理人さんのフレーバーも効いているという感想には同意です。
ストーリー的には、推定の天底がパワーアップと言うよりも、その瀕死か遺骸の深淵の獣が取り込み変質したのでしょうかね。どちらにせよ、我々の世界で見るとこいつがSモンスターである都合上、チューナーが必要。よって、（烙印の光で）伸ばされたアルバスの手は・・・

除外を能動的に使うテーマですし、除外したブルーアイズを帰還させるなど火力のもう一押しなどにも使えそうですかね。

自分の想像しているものとコンセプトもろとも違いそうですが、ヴァンパイアにビーステッドとこの①で実質コントロール奪取できるとシェリダンが出しやすそうで良いなと思う。ただ、そんな枠はなさそうですが。
個人的に将来にランク10のシェリダンと同じX召喚素材軽減持ちが開発されたなら使ってみたい。